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林志輝 副教授

林志輝

 

現職

副教授

學歷

國立臺灣大學生化科技學系 生物工業組 博士

專長

基因體學、發酵生產製程、微生物分子分型與鑑定、微生物即時定量PCR以及其他PCR檢測分析方法

獲獎

103年度全校傑出教學獎

106 年度科技部獎勵特殊優秀人才

109 年度科技部獎勵特殊優秀人才

110 年度科技部獎勵研究

111 年度國科會獎勵研究

112 年度國科會獎勵研究

113 年度國科會獎勵研究

經歷

2010-2011   國立臺灣大學邁向頂尖大學計畫博士後研究

2011-2018  國立臺東大學生命科學系 助理教授

2017 迄今   衛福部食品藥物管理署驗證檢驗機構評審委員

2018 迄今   國立臺東大學生命科學系 副教授

2020.2.1~2026.1.31   國立臺東大學生命科學系 系主任

連絡電話

089-318855#6518

E-mail

chlin@nttu.edu.tw

 研究室介紹：

       研究主軸為利用分子生物與發酵技術，進行食品微生物研究。其中包含微生物菌相分析、總體基因體（metagenomics）分析、微生物鑑定與即時定量 PCR 分析方法、紅麴菌遺傳工程、紅麴功能性成分生產純化、乳酸菌發酵生產製程與微生物功能性基因體分析等。 

 研究主題：

  1. 紅麴菌功能性基因體與系統分類
  2. 紅麴菌黃色素生產純化
  3. 乳酸菌基因體學與發酵製程
  4. 生物反應器設計
  5. 環境與腸道微生物菌相分析
  6. 微生物分子分型、鑑定與偵測定量
  7. 即時定量PCR 分析檢驗方法開發

可學習之專業能力：

1. 食品微生物檢測與鑑定。

2. 微生物遺傳工程操作。

3. 生物反應器設計與發酵製程技術。

4. 總體基因體定序與生物資訊學分析。

5. 微生物菌相分析與功能性基因體分析。

畢業生未來可投入之產業：

1. 生物科技產業如食品、保健食品與生技醫藥等

2. 微生物分析檢驗如食品化妝品檢驗公司等

3. 生物相關學術研究機構

    
 

 研究計畫：

  • 科技部計畫

1. 總體基因體分析應用於食品中非預期微生物汙染監測及鑑別之研究。114年度國科會計畫 (14-2320-B-143 -002)

2. 整合開發電子鼻感測器與垂直板式固態發酵反應器應用於高經濟價值真菌發酵生產之研究。112年度國科會計畫 (112-2320-B-143 -001)

3. 以垂直板狀澱粉基質進行紅麴菌固態發酵生產黃色素製程開發。109-111年度科技部計畫 (109-2320-B-143 -001 -MY3)

4. 以液態發酵生產紅麴菌主要功效代謝物 monascin 與 ankaflavin。108年度科技部計畫 (108-2320-B-143-001)

5. 以次級代謝物層析圖譜與菌種鑑別 PCR 進行紅麴米以及紅麴健康食品中紅麴菌菌種鑑別。106年度科技部計畫 (106-2314-B-143 -001)

6. 紅麴菌 Monacus pilosus與 Monascus ruber 分類地位與分子鑑別之探討。105年度科技部計畫 (105-2320-B-143 -001)

7. 紅麴菌種分子分型方法建立與中藥材紅麴米中紅麴菌種調查。104年度科技部計畫 (104-2311-B-143-001)

8. 綠島朝日溫泉潮間帶微生物群落分析與調查。102年度科技部計畫 (102-2313-B-143-001)

9. 台東地區溫泉嗜熱菌及耐熱冷菌之分離、鑑定與特性分析。101年度國科會計畫 (101-2313-B-143-002)

  • 產學合作計畫

1. (113-115) 紅麴菌育種篩選研究。委託單位：晨暉生物科技股份有限公司。

2. (113-115) 乳酸菌氣舉式發酵製程開發與其逆境反應探討。委託單位：晨暉生物科技股份有限公司。

3. (111) 以3D列印製程探討立體結構改善乳酸菌在冷凍乾燥產品製程中存活率提升的可能性。委託單位：晨暉生物科技股份有限公司。

4. (111) 李斯特菌及沙門氏菌快速增殖培養液。委託單位：啟新生物科技股份有限公司。

5. (110) Lacticaseibacillus paracasei subsp. Paracasei NTU 101 (NTU 101) 的基因體分析。委託單位：晨暉生物科技股份有限公司。

6. 110 年度地方型SBIR研究計畫: 蒸在地-台東特色暨創新五行香腸產品研發。委託單位：臺東縣政府/吉利哥有限公司。

7. 108 年度地方型SBIR研究計畫: 臺灣香檬 DIY 手做產品開發。委託單位：臺東縣政府/東湘農創。

8. 107 年度地方型SBIR研究計畫: 新型態粉茶產品製程。委託單位：臺東縣政府/東傑茶園。

9.105 年度地方型SBIR研究計畫: 芭樂心葉茶多酚降血糖確效分析。委託單位：臺東縣政府/三禾家。

10.104年度工研院微型產業技術輔導計畫: 延長木耳露保存期限製程開發。委託單位：工研院/黑耳喜。

11. (104-105) 紅藜預防酒精肝損傷保健食品開發之研究計畫。委託單位：信豐農業技術股份有限公司。

12. (104) 茶飲料產品之健康食品調節血脂功效評估研究計畫。委託單位：臺灣檢驗科技股份有限公司。

13. (104) 蝦紅素膠囊產品之健康食品調節血脂功效評估。委託單位：臺灣檢驗科技股份有限公司。

14. 101 年度地方型SBIR研究計畫: 以咖啡果肉為原料之「咖啡醋」小規模生產製程建立。委託單位：臺東縣政府/曲禾酒莊

  • 其他計畫

1. 智慧農業跨域整合AI應用人才培育計畫。114年度教育部智慧雨林產業創生計畫。

2. 106-108 年度學界關懷計畫，輔導廠商: 錦鸞商行、好穀栗企業社、東傑茶園與東軒坊。

 專利發明：

  1. Tzu-Ming Pan; Chih-Hui Lin*; Tsung-Wei Shih. Probiotic composition containing Lactobacillus paracasei subsp. paracasei NTU 101 for ameliorating intestinal flora and reducing gastric mucosal lesion index and histamine concentration in gastric mucosal. 美國專利US9394575。日本專利JP5973537。韓國專利 KR101732778。
  2. Tzu-Ming Pan; Chih-Hui Lin*; Tsung-Wei Shih. Lactobacillus Mutant, Nucleotide Sequence for Lactobacillus Mutant and Primers for Nucleotide Sequence of Lactobacillus Mutant. 韓國專利 KR20150063303。歐盟專利 EP2891711。中國專利CN104673700。加拿大專利CA2872584。

 期刊論文：

  1. Liu TH, Chen GL, Lin CH*, Tsai TY, Cheng MC. Lactobacillus plantarum TWK10 relieves loperamide-induced constipation in rats fed a high-fat diet via modulating enteric neurotransmitters, short-chain fatty acids and gut microbiota. Food & Function. 2026,16: 181-194.
  2. Chen CT, Chao WY, Lin CH*, Shih TW, Pan TM. Comprehensive Safety Assessment of Lacticaseibacillus paracasei subsp. paracasei NTU 101 Through Integrated Genotypic and Phenotypic Analysis. Current Issues in Molecular Biology. 2024, 46(11):12354-12374.
  3. Lin TH, Shih TW, Lin CH*#. Effects of Lactocaseibacillus paracasei subsp. paracasei NTU 101 on gut microbiota: a randomized, double-blind, placebo-controlled clinical study. Journal of the Science of Food and Agriculture. 2024, 104(15):9494-9505.
  4. Lin TS, Chiu SH, Chen CC, Lin CH*#. Investigation of monacolin K, yellow pigments, and citrinin production capabilities of Monascus purpureus and M. ruber (M. pilosus). Journal of Food and Drug Analysis. 2023, 31(1):85-94.
  5. Lin CH*, Shih TW, Pan TM. A "Ct contrast"-based strain-specific real-time quantitative PCR system for Lactobacilllus paracasei subsp. paracasei NTU 101. Journal of Microbiology, Immunology and Infection. 2018, 51:535-544.
  6. Lin TH, Lin CH*#, Pan TM. The implication of probiotics in the prevention of dental caries. Applied Microbiology and Biotechnology. 2018, 102:577-586.
  7. Lin CH*, Lin TH, Pan TM. Alleviation of metabolic syndrome by monascin and ankaflavin: the perspective of Monascus functional foods. Food & Function. 2017, 8:2102.
  8. Lin CH*, Chen YH, Tsai TY, Pan TM. Effects of deep sea water and Lactobacillus paracasei subsp. paracasei NTU 101 on hypercholesterolemia hamsters gut microbiota. Applied Microbiology and Biotechnology. 2017 , 101(1):321-329.
  9. Lin CH*, Pan TM. Perspectives on genetically modified crops and food detection. Journal of Food and Drug Analysis. 2016, 24(1):1-8.
  10. Tan YY, Hsu WH, Shih TW, Lin CH*, Pan TM. Proteomic insight into the effect of ethanol on citrinin biosynthesis pathway in Monascus purpureus NTU 568. Food Research International. 2014, 64:733-742. 
  11. Lin CH*, Chen YC, Pan TM. Quantification Bias Caused by Plasmid DNA Conformation in Quantitative Real-Time PCR Assay. PLoS One. 2011;12:e29101.
  12. Lin CH*, Pan TM. Assessing the digestion of a genetically modified tomato (Solanum lycopersicum) R8 DNA in simulated gastric fluid using event-specific real-time PCR. European Food Research and Technology. 2011, 232:1061-1067.
  13. Lin CH*, Pan TM. PCR-Denaturing Gradient Gel Electrophoresis Analysis To Assess the Effects of a Genetically Modified Cucumber Mosaic Virus-Resistant Tomato Plant on Soil Microbial Communities. Applied and Environmental Microbiology. 2010, 76:3370-3373.
  14. Lu IJ, Lin CH*, Pan TM. Establishment of a system based on universal multiplex-PCR for screening genetically modified crops. Analytical and Bioanalytical Chemistry. 2010, 396:2055-2064.
  15. Lin CH*, Sheu F, Lin HT, Pan TM. Allergenicity assessment of genetically modified cucumber mosaic virus (CMV) resistant tomato (Solanum lycopersicon). Journal of Agricultural and Food Chemistry. 2010, 58:2302-2306.
  16. Lin CH*, Lu CT, Lin HT, Pan TM. Safety assessment and detection method of genetically modified Chinese kale (Brassica oleracea cv. alboglabra). Journal of Agricultural and Food Chemistry. 2009, 57:1876-1881.
  17. 曾子芸，林姿杏，潘子明，林志輝。(2019) Lactobacillus paracasei subsp. paracasei NTU 101液態發酵培養的最適氧氣與pH值條件探討，台灣農業化學與食品科學。57:3,133-142。

 專書：

  1. Lin CH*, Pan TM. Safety assessment of genetically modified (GM) crops: current protocol, research trend and future challenge. 2011. ISBN:978-1-61209-662-9 2011.

 專題演講：

  1. 林志輝 (2024) Gut microbiota modulation effect of Lactiplantibacillus plantarum TWK10 on loperamide-induced constipation in high fat diet rats. 2024牛樟芝與天然物及益生菌研究開發學術研討會。
  2. 林志輝 (2019) 探討降膽固醇保健素材 Lactobacillus paracasei subsp. paracasei NTU 101 與深層海水對於高膽固醇血症倉鼠動物模式腸道菌相變化的影響。發酵生物技術前瞻應用—銀髮保健產業加值新契機
  3. 林志輝 (2017)。 Effects of geothermal heating, temperature fluctuation and tides on the intertidal hot-spring microbiota of Green Island。2017細菌學研討會。
  4. 林志輝 (2017)。由基因體分析探討紅麴菌種 Monascus purpureus、M. ruber 以及 M. pilosus 重要二次代謝物生合成能力及其在保健食品的應用。2016東區生物科技及生物醫學研討會。

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