生命科學系

 研究室介紹：

       研究主軸為利用分子生物與發酵技術，進行微生物與農業應用的相關研究，其中包含宏觀基因體（metagenomics）分析、微生物分子分型與鑑定、即時定量 PCR 檢驗分析方法開發、發酵生產製程與微生物基因體分析等。    

 研究主題：

1. 紅麴菌功能性基因體與系統分類
2. 紅麴菌黃色素生產純化
3. 乳酸菌基因體學與發酵製程
4. 生物反應器設計
5. 環境與腸道微生物菌相分析
6. 微生物分子分型、鑑定與偵測定量
7. 即時定量PCR 分析檢驗方法開發

可學習之專業能力：

1. 分子生物操作

2. 微生物操作

3. 發酵技術

4. 微生物鑑定分型

5. 菌相分析與基因體分析

畢業生未來可投入之產業：

1. 微生物發酵相關產業如食品發酵與酵素生產等

2. 生物技術研發與分析如基因檢測與菌種鑑定等

3. 微生物相關學術研究機構 

 研究計畫：

• 科技部計畫
  1. 台東地區溫泉嗜熱菌及耐熱冷菌之分離、鑑定與特性分析。101年度國科會計畫 (101-2313-B-143-002)
  2. 綠島朝日溫泉潮間帶微生物群落分析與調查。102年度科技部計畫 (102-2313-B-143-001)
  3. 紅麴菌種分子分型方法建立與中藥材紅麴米中紅麴菌種調查。104年度科技部計畫 (104-2311-B-143-001)
  4. 紅麴菌 Monacus pilosus與 Monascus ruber 分類地位與分子鑑別之探討。105年度科技部計畫 (105-2320-B-143 -001)
  5. 以次級代謝物層析圖譜與菌種鑑別 PCR 進行紅麴米以及紅麴健康食品中紅麴菌菌種鑑別。106年度科技部計畫 (106-2314-B-143 -001)
  6. 以液態發酵生產紅麴菌主要功效代謝物 monascin 與 ankaflavin 。108年度科技部計畫 (108-2320-B-143-001)

• 產學合作計畫
  1. 101 年度地方型SBIR研究計畫: 以咖啡果肉為原料之「咖啡醋」小規模生產製程建立。委託單位：臺東縣政府/曲禾酒莊。
  2. (104) 蝦紅素膠囊產品之健康食品調節血脂功效評估。委託單位：臺灣檢驗科技股份有限公司。
  3. (104) 茶飲料產品之健康食品調節血脂功效評估研究計畫。委託單位：臺灣檢驗科技股份有限公司。
  4. (104-105) 紅藜預防酒精肝損傷保健食品開發之研究計畫。委託單位：信豐農業技術股份有限公司。
  5. 105 年度地方型SBIR研究計畫: 芭樂心葉茶多酚降血糖確效分析。委託單位：臺東縣政府/三禾家。
  6. 104年度工研院微型產業技術輔導計畫: 延長木耳露保存期限製程開發。委託單位：工研院/黑耳喜。
  7. 107 年度地方型SBIR研究計畫: 新型態粉茶產品製程。委託單位：臺東縣政府/東傑茶園。
  8. 108 年度地方型SBIR研究計畫: 臺灣香檬 DIY 手做產品開發。委託單位：臺東縣政府/東湘農創。
  9. 參與 106-108 年度學界關懷計畫，輔導廠商: 錦鸞商行、好穀栗企業社、東傑茶園與東軒坊。

 期刊論文：

1. 曾子芸，林姿杏，潘子明，林志輝  (2019) Lactobacillus paracasei subsp. paracasei NTU 101液態發酵培養的 最適氧氣與pH值條件探討 ，台灣農業化學與食品科學 。 57:3,133-142。
2. Chih-Hui Lin, Tzu-Hsing Lin and Tzu-Ming Pan (2017). Alleviation of metabolic syndrome by monascin and ankaflavin: the perspective of Monascus functional foods. Food & Function, 8, 2102. (SCI).
3. Chih-Hui Lin, Tsung-Wei Shih, Tzu-Ming Pan (2017). A "Ct contrast"- based strain-specific real-time quantitative PCR system for Lactobacilllus paracasei subsp. paracasei NTU 101. Journal of Microbiology, Immunology and Infection. (Accepted). (SCI).
4. Chih-Hui Lin, Yu-Hsin Chen, Tsung-Yu Tsai and Tzu-Ming Pan (2017). Effects of deep sea water and Lactobacillus paracasei subsp. paracasei NTU 101 on hypercholesterolemia hamsters gut microbiota. Applied Microbiology and Biotechnology, 101:321-329. (SCI).
5. Chih-Hui Lin, Tzu-Ming Pan (2016). Perspectives on genetically modified crops and food detection. Journal of Food and Drug Analysis, 24:1-8. (SCI).
6. Tan YY, Hsu WH, Shih TW, Lin CH, Pan TM (2014). Proteomic insight into the effect of ethanol on citrinin biosynthesis pathway in Monascus purpureus NTU 568. Food Research International, 64:733-742. (SCI).
7. Lin CH, Chen YC, Pan TM (2011). Quantification Bias Caused by Plasmid DNA Conformation in Quantitative Real-Time PCR Assay. PLoS one, 12: e29101. (SCI).
8. Lin CH, Pan TM (2011). Assessing the digestion of a genetically modified tomato (Solanum lycopersicum) R8 DNA in simulated gastric fluid using eventspecific real-time PCR. European Food Research and Technology, 232:1061- 1067. (SCI).
9. Lin CH, Pan TM (2010). PCR-denaturing gradient gel electrophoresis analysis to assess the effects of a genetically modified cucumber mosaic virus-resistant tomato plant on soil microbial communities. Applied and Environmental Microbiology, 76: 3370-3373. (SCI).
10. Lu IJ, Lin CH, Pan TM (2010). Establishment of a system based on universal multiplex-PCR for screening genetically modified crops. Analytical and Bioanalytical Chemistry, 396:2055-2064. (SCI).
11. Lin CH, Sheu F, Lin HT, Pan TM (2010). Allergenicity assessment of genetically modified cucumber mosaic virus (CMV) resistant tomato (Solanum lycopersicon). Journal of Agricultural and Food Chemistry, 58:2302-2306. (SCI).
12. Lin CH, Lu CT, Lin HT, Pan TM (2009). Safety assessment and detection method of genetically modified Chinese kale (Brassica oleracea cv. alboglabra). Journal of Agricultural and Food Chemistry, 57:1876-1881. (SCI).

 專書：

1. Lin CH, Pan TM. Safety assessment of genetically modified (GM) crops: current protocol, research trend and future challenge . Safety assessment of genetically modified (GM) crops: current protocol, research trend and future challenge. 2011. ISBN:978-1-61209-662-9 2011.

 研討會論文：

1. Lin CH, Pan TM (2009). Allergenicity assessment of genetically modified cucumber mosaic virus resistant tomato (Solanum lycopersicon). Institute of Food Technologists 2009 annual meeting.
2. Lin CH, Lu IJ, Pan TM (2010). Universal multiplex-PCR based genetically modified crops screening system. International Symposium of the Kanagawa University-National Taiwan University Exchange Program.
3. 林志輝、潘子明（2010）。基因改造抗胡瓜嵌紋病毒番茄非預期效應之研 究。台灣農業化學會第四十八次會員大會。
4. Shih CC, Yuan KC, Lin CH (2013). Isolation, Identification and Enzyme Activity Screening of Thermophiles/Halophiles in Taitung Hot springs. 2013 The 5^th Taiwan-Korea-Japan International Symposium on Microbial Ecology.
5. Yuan KC, Shih CC, Lin CH (2013). Sporosarcina sp. D27, A Novel Temperature Tolerant Bacteria Isolated From LuYe Creek. 2013 The 5^th Taiwan-Korea-Japan International Symposium on Microbial Ecology.
6. Lin CH, Pan TM (2011). Study on the unintended effects of a genetically modified Cucumber Mosaic Virus resistant tomato R8. Institute of Food Technologists 2011 annual meeting.
7. 戴才芸、林志輝（2015）。綠島朝日溫泉潮間帶微生物群落分析與調查。慈濟大學與東華大學學術交流研討會。
8. 黃聖權、林志輝（2015）。M. purpureus 菌種鑑定方法開發。慈濟大學與東華大學學術交流研討會。
9. 林志輝 （2016）。由基因體分析探討紅麴菌種 Monascus purpureus、M. ruber 以及 M. pilosus 重要二次代謝物生合成能力及其在保健食品的應用。2016東區生物科技及生物醫學研討會。
10. 潘意凌、吳明臻、邱世浩、陳倩琪、林志輝（2016）。紅麴菌 Monascus purpureus、M. ruber 以及 M. pilosus 重要二次代謝物生合成能力的探討。2016東區生物科技暨生物醫學研討會。
11. 沈威邑, 邱世浩, 陳倩琪, 林志輝 （2016）。紅麴菌 Monascus pilosus 與 Monascus ruber 二次代謝物生合成相關基因的種間差異度及分類地位探討。台灣保健食品學會與台灣抗老化保健學會2016年會員大會暨老化健康照護國際研討會。
12. 潘意淩, 吳明臻, 邱世浩, 陳倩琪, 林志輝（2016）。紅麴菌M. purpureus、M. pilosus 與M. ruber 基因體中citrinin 生合成基因簇的比較。台灣保健食品學會與台灣抗老化保健學會2016年會員大會暨老化健康照護國際研討會。
13. 林志輝 (2017)。 Effects of geothermal heating, temperature fluctuation and tides on the intertidal hot-spring microbiota of Green Island。 2017細菌學研討會。
14. 曾子芸、蔡宜欣、張伊萱、林志輝 (2017)。 Lactobacilllus paracasei subsp. paracasei NTU 101 之發酵條件及冷凍乾燥製程最適化。 2017東區生物科技及生物醫學研討會。
15. 陳順達、施政嘉、林志輝 (2017)。重組 Anoxybacillus flavithermus HY-TTH-D23 熱穩定 alpa-辦乳糖苷酶酵素生產與特性分析。2017東區生物科技及生物醫學研討會。
16. 林志輝 (2019) 探討降膽固醇保健素材 Lactobacillus paracasei subsp. paracasei NTU 101 與深層海水對於高膽固醇血症倉鼠動物模式腸道菌相變化的影響。發酵生物技術前瞻應用—銀髮保健產業加值新契機研討會。